中國海關總署在裴洛西訪台前一天深夜，宣布台灣有多家食品公司，沒有完成更新註冊，因此暫停進口。農委會也證實，以水產品、茶葉、蜂蜜等產業為主，至於水產同業公會則表示，還在釐清。如果產業受衝擊，農委會表示，將研擬相關措施協助業者。
在中國海關總署網頁查詢註冊訊息，可見台灣企業，有的狀態有效，有的暫停進口，水產工業同業公會指出，84家會員一半遭暫停進口，先前對岸通知6月30日前要更新註冊且完成補件，但會員不太清楚現在是補件未完成、或是完成補件後被退件？仍在設法釐清。
台灣水產工業同業公會秘書長吳姿蓉表示，儘量提供符合他們的需求的文件，希望他們能夠站在貿易自由化的角度，能夠用合理的角度面對這樣的事件。
公會表示有會員對突如其來的暫停輸入措手不及，目前先專注於完備程序，而名單中也有為數不少的漁船，暫停進口對漁民生計衝擊有多大？其中琉球區漁會表示確切情況待官方調查。
是否因美國眾議院長裴洛西即將到訪，中國再對台灣農產品出手禁運？農委會表示，眼前先輔導業者完成註冊。
農委會國際處長林家榮說：「中國大陸並不是禁止我們所有的食品跟農產品的進口，還沒有完成註冊登記的原因，我們農委會已經進一步跟個別廠商來了解。」
中國去年要求全世界輸中的食品企業，皆須申請註冊，期限至六月底，農委會指出已協助水產品、茶葉、蜂蜜等產業配合辦理，若此次有衝擊會研擬措施因應，而台灣養蜂協會指出，國產蜂蜜產量有限，主要自產自銷，初步未見影響。
