載滿淡菜的漁船要上岸，但是困難重重，馬祖淡菜養殖業者池瑞銀指出：「像這樣(你的船)不能進來，進來底盤就會撞到石頭，撞到石頭就容易破損啊，以前是沒有石頭的，以前看不到的，都是沙子。」
同樣的情形也發生在金沙海灘，馬祖民宿業者林建中表示：「會刮走是好幾天，一兩個禮拜以上的時間慢慢帶走，不可能一下子不見。(抽砂船)那是兩天的時間，忽然不見。」
居民表示，今年中秋節，原本伴隨東北季風來的魚明蝦、白蝦、烏魚、 黑鯛，也少了很多，這種現象應該都和抽砂船抽砂有關。馬祖淡菜養殖業者池瑞銀指出：「現在因為抽砂船抽得太嚴重，把外面的沙子都抽光了，沙子自然彌補空洞的現象，就是把這邊的沙子往外移，往外移以後呢，我們這邊沙灘的沙子就不見了。」
在金門，因為對岸都市發展與興建廈門翔安機場需要填海造陸，在金廈水域已經收砂十幾年，金門西北邊的洋山沙灘，因為沙子流失，岸邊的先人墓區也受到影響。
金門縣議員董森堡感嘆：「很心酸，我是覺得說好可憐，是不是三五成群的，它不是一兩個喔，它是整個都被掏刷出來。」
記者中秋節前夕到金門洋山拍攝，在固沙的巨大石塊之間，還是可以看見繼續被沖刷出來的人骨及金甕碎片。 值得注意的是，抽砂船這兩年在澎湖的重要魚場、台灣淺灘抽砂，可能會破壞了土魠、鰮魚的繁衍棲地。
中研院生物多樣性研究中心研究員鄭明修表示：「就不會孕育浮游植物、浮游動物，可以在這邊長期停留，漁場就是整個的地理環境被改變了。」
國土西疆、澎湖金門和馬祖，都遭遇抽砂船的抽砂危機，除了海巡加強驅離以及查扣抽砂船之外，經濟部和內政部分別研議修改土石採取法以及中華民國經濟海域及大陸礁層法，來加重抽砂船員刑度到七年，罰金上修到八千萬元，希望達到嚇阻的作用。
