福島核災發生後，全球最多曾有54國，對日本產的食品進口加以管制，但目前除了南韓、中國，台灣也還是禁止包括福島與周遭茨城、櫪木、群馬、千葉4縣市等地區農產品及食品進口，WTO於當地時間11號認定，南韓主張有理，大逆轉判決日本敗訴，對於此結果，台灣食藥署表示，目前核食禁令不變。
食藥署食品組副組長 魏任廷表示，「這一份報告書裡面，對於一審裁決的一些認定上覺得有誤，會持續依照這個公投的結果，維持日本輸入的食品，來做相關的管制。」
雖然總統蔡英文上任後曾一度說要解禁，引發各界討論，去年9合一大選反核食公投，最終是以779萬1856票同意，通過門檻，依照公投法，政府繼續維持禁令，日本甚至揚言不排除向WTO提告，但學者認為，依WTO最新判例結果，提告後不見得有利日方。
台經院景氣預測中心副主任 邱達生分析，「這樣子的一個爭端解決機制的一個訴訟，日本敗訴的話，日本將來想要在同樣的類似的議題，能夠勝訴機會就相對比較小。」
學者表示，雖然日本認為台灣也違反了WTO對外最惠國待遇等標準，但因為爭端解決機制訴訟通常都會參考前例的判決，反而為台灣將來爭取加入CPTTP跨太平洋夥伴全面進步協定開了一道曙光，日本將不能再以核食問題來做為反對的理由。
