高端疫苗取得衛福部EUA的認證，最快8月應該能少量供應，由於這次高端緊急授權是採用獨步全球的免疫橋接，加上沒有三期臨床試驗，且從食藥署所公布的數據，高端疫苗組與AZ疫苗組的原型株活病毒，中和抗體幾何平均效價比值的95%信賴區間下限為3.4倍，遠大於標準要求0.67倍。不過國內專家認為，抗體不等於實際施打的保護力。
中研院生醫研究所兼任研究員何美鄉表示，「中和性抗體的高跟低是跟保護性有呈正相關，但是正相關不一定是一個1:1，就是我是你的三倍，我的保護性就是你的三倍，不是這樣。」
防疫學會理事長王任賢指出，「因為高端就是想用對武漢病毒(原始株)的中和抗體效價，來代表能夠對Alpha、Beta、Delta、Gamma(變種)病毒都有保護力，這個是一個天大的錯誤。當初就是因為高端內部的資料流出來，證實對這些變異病毒效果可能不盡理想。」
專家認為，高端疫苗和AZ疫苗中和抗體的比較數據為3.4倍，僅代表高端通過食藥署自行制訂的特有標準，高端可以開始專案製造疫苗，至於科學上則意義不大。這回高端通過EUA後，也讓外界質疑，美國當時審查輝瑞疫苗EUA時都是全程錄影公開，為何台灣沒有?
受試者保護協會常務理事郭英調說：「美國的藥物審議委員會，他們要審議，審一個藥物要不要讓它通過的時候，是電視直播給所有人看，任何一個委員要表達贊同還反對，通通都要解釋為什麼。」
中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中對此回應，「全部都公開有全部公開的好處，這樣等於是一個相對不公開也有不公開的好處，不公開的情況大家可以比較暢所欲言，相關會議紀錄還是會去識別化的來公告。」
陳時中表示，現在大家看到的幾個大廠牌都是完成二期試驗，進行三期試驗時提出期中報告被授與EUA，高端等於是二三期連接試驗，擴大二期試驗的人數，過程都能讓國際社會驗證。
針對外界種種質疑聲浪，高端也發出重大訊息表示，公司在7月6日向巴拉圭醫藥法規主管機關，國家衛生監督局提出第三期臨床試驗申請，經審查評估後，已獲准於巴拉圭執行新冠肺炎疫苗第三期臨床試驗，目標是今年第3季完成約1000名受試者的收案，第4季取得期中分析數據。
