教育部長潘文忠請辭後，由中研院士也是東華大學前校長吳茂昆接下新任部長重擔。吳茂昆上任後，除了要面對近期最受爭議的台大校長人事案之外，近年來，高教端要面臨人才流失、國際排名後退等問題，甚至還有國教課綱、幼教發展等各面向的議題需要解決。

教育部長將由東華大學前校長吳茂昆接任，最先要處理的燙手山芋，就是從1月開始紛擾至今的台大校長人事案。

全教總理事長張旭政認為，「新部長上來對他來講，可能會是用政治意識形態去處理的狀況會比較多。（政院說法）他只是去做所謂的短期的講座，跟管中閔的兼職不一樣，其實已經在做一個切割的處理。」

台大爭議要解，潘文忠任內提出的高教深耕，玉山學者等各項計畫要達成留才、攬才目標，也曾引起圖利財團等批評，未來，經費如何分配，能否留住人才，也是重點。

高教工會組織部主任林柏儀指出，「教育部長應該要拿出更充足的手段，扭轉過去過度集中，可以說是懸殊的資源分配方式；（例如）你常態性的給予補助，但是你要要求董事會裡面，要有公益董事的席次，校政裡面的施政 不可以違反教育的相關法令，這是教育部才應該要做的權責。」

而外界也擔心，吳茂昆雖曾任大學校長，是中研院院士，但在國教與幼教領域，相對不熟悉；過去潘文忠曾不同意，行政院長賴清德提出的私幼公共化，傳出為此請辭，而未來院出身的吳茂昆，是否真能對教育現場有深入了解？

張旭政則認為，「國家有限的資源，應該要廣設公立跟非營利幼兒園，所以我們希望吳部長是一個有教育思維的部長，而不是一個為政治立場考量，為政治政策考量的一個部長。」

此外，十二年國教課綱能否在明年如期上路，相當專業的課程討論，需要吳茂昆投入更多心力！確定接任不到18小時，各教育團體已對吳茂昆提出想法與建言。