校長遴委只能連任一次，遴委會怠於執行任務或三個月內無法處理爭端，校務會議議決後解散，教育部再度預告國立大學校長遴委會組織及運作辦法修正草案，引起爭議。部長潘文忠表示，修法最大前提還是大學自主。
教育部長 潘文忠表示，「其實程序公開資訊透明這件事情，還有利益迴避，是引發不少爭議的點，那對於遴選委員會一旦，有一些爭議等等相關的這些情形，其實也希望回歸到，是由學校自主的這個前提去做解決。」
賦予校務會議解散校長遴委會權限，潘文忠強調，教育部不會插手，接下來會再聽取大學意見。成大主秘 李俊璋則指出，成大去年成立法制研修小組，準備修訂校長遴選辦法，就是因為大原則遲未確定，因而停滯。
成大主秘 李俊璋說：「這個前提是校長遴選委員會，有發生爭執，這個時候，我們大概會依照，教育部的修法的方向，去做一些研議啦。」
對教育部修法，台大由主秘 孫效智首度發出文字回應，孫效智指出，修正草案大體上可以接受，最重要的是遴選委員及候選人之間應揭露關係的詳細規定，以及遴選委員迴避的具體作法與機制。不過規定過於細瑣，有矯枉過正之嫌，但遴選辦法生效，讓國立大學未來的校長遴選，有具體的依法行政基礎。
