受到武漢肺炎疫情影響，藥局缺藥狀況時有所聞。儘管食藥署多次澄清台灣沒有缺藥疑慮，但現在傳出有部分大型醫院，早在疫情發生初期就開始大量囤藥，食藥署已要求這些醫院藥品超量部分得通通退還。食藥署藥品組簡任技正潘香櫻表示，「可能他們是未雨綢繆，就是可能就像跟儲備衛生紙一樣，大家有時候有一些預期的心態，然後會去做這樣子的事情。」
根據食藥署了解，目前市面缺貨且有實際囤貨的藥品，主要為七、八種品項的甲狀腺用藥及部分心臟用藥。食藥署祭出武漢肺炎防疫期間藥品分配不均之處理指引，包括已超量訂購藥品的醫院，必須將超量藥品退回原經銷藥商。直到該醫療機構藥品存量，降到前一年月平均實際用量為止。另外，疫情期間醫療機構門診量下降，恐造成庫存量增加，醫療機構應評估並調整次月藥品訂購量。台灣私立醫療院所協會理事長朱益宏說：「我跟廠商叫了這個藥以後，我就要付錢給廠商，因為都是健保給付的藥，就是憑處方箋。有多少病人，病人需要，他就憑處方箋給病人，所以並不像什麼衛生紙，我囤起來我可以賣錢。」
而為了釐清這些大醫院當時超量叫貨，究竟有沒有涉及囤藥行為？食藥署將進一步稽查，再依公平交易法或醫療法令等相關規定處置。
