本土疫情大爆發，也讓大專校院的確診和居隔人數提升，導致防疫量能不足，而教育部開放大專校院進行防疫授課演練，可以小規模、分批次遠距授課，以1到2週為原則，包含台大、台師大、 台科大等多所學校，從下星期一9日開始，全校遠距教學2個星期。
本土疫情嚴峻，各大學確診學生的安置，也相當頭痛。台中東海大學學生會控訴，校方為了要安置確診學生，要求健康學生必須得自願返家，不少學生感覺被當人球，遠距教學配套也不明確。東海大學表示，這是要為了保有安置量能，健康同學移動也相對容易，因此採取鼓勵措施，否認強迫性質。
臺灣大學有確診學生投訴，講in被 tshua7 去會議室隔離，無浴間睏塗跤。今仔日閣有學生搤空，講學校佇宿舍地下室搭棚仔做隔離室。臺大解說，這2日確診佮隔離的人數雄雄增加，空間無夠是臨時因應。
台灣大學昨（2）日有確診學生投訴，被安置到會議室隔離，沒衛浴，拿睡袋打地舖，今日又有學生爆料，學校在宿舍地下室搭帳蓬充當隔離室。台大解釋，5月1、2日全校有86人確診，還有匡列超過20位密切接觸者的突發事件，隔離宿舍量能不足、資源有限，只能先以此因應。但確診人數快速增加，北部多所大學都遇上安置難題。
Hualien's Tzu Chi University of Science and Technology reported that at least 5 students and 1 teacher were diagnosed with COVID-19. Students living in the same dorm are angry and said the school did
校園停課標準修正，教育部發函各大學說明，要求學校預先規畫「隔離宿舍」，若學生遭匡列為密切接觸者時，可在學校宿舍隔離。但在教育部發函前，位於花蓮的慈濟科大，傳出至少5位到醫院實習的學生和1名老師確診。有住宿生指控，學校沒告知同層住宿生有確診者要注意，也沒有讓全部學生去快篩，造成學生和家長恐慌。
教育部統計，截至昨天下午5點，已有3888位境外學位生入境，接著14+7後就能入校、入住宿舍。但境外生權益小組指出，台大要求完成檢疫的境外生，需額外自費PCR陰性才可入住，還禁止在BOT宿舍的單人房自主管理，認為台大的防疫政策太荒謬。
各大學九月中之後陸續開學，由於雙北疫情變化，加上中秋連假可能群聚，不少大學已宣布，開學前兩周或前三周皆採遠距教學。但要入住宿舍的新生怎麼辦？各校又有不同對應，以台大為例，原訂9月14後陸續入住，將延到10月2日到10月12日分批入住，在這之前，要入住採個案申請。
大學將於9月中下旬陸續開學，台大宣布校友熱心捐贈一萬劑快篩試劑，將提供給大學部新生以及校內住宿生免費篩檢，校方未來也會視需求規劃購置額外的快篩試劑。台大指出，在施打疫苗前提供校內足夠的篩檢量能，是規劃的重點，校友熱心捐贈一萬劑的快篩試劑，校方決定提供給大學部新生及校內住宿學生，作為需要時先行自我檢測的安心物資，一旦檢測出現陽性，校方會依循防疫準則、進一步協助和安置。陽明交通大學也在校內設置集中篩檢
成大要求三級警戒期間曾返鄉又回到學校的住宿生，須自費500元做PCR檢測，且若未返鄉的室友不同意其回到房間，就會安排到一人一室的宿舍區，卻遭學生投訴限制人身自由。 校園內空蕩蕩只剩零星師生走動，6月初文化大學發生宿舍群聚感染，讓成大校方不敢大意，制定住宿防疫措施，3500多名住宿生中有2500名配合不返鄉，但仍有少數學生因實驗或私事返鄉後又回學校，他們被要求須自費500元做PCR檢測，或需
