健保開辦30年累積龐大醫療資料庫，常提供給學術單位進行研究，引發外界質疑侵犯隱私權，憲法法庭2022年宣判必須給民眾「退出權」。對此，立法院衛環委員會9日上午排審《全民健康保險資料管理條例》草案，希望設立專法監督管理。衛福部強調不論草案是否完成三讀，退出權都會如期在今（2025）年8月12日上路，初步規劃書面申請，也就是不會提供個人醫療資料給任何單位2次利用。
只要出示健保卡就能到住家附近醫療院所看病，非常方便，不過健保開辦30年累積龐大醫療資料庫，常提供給學術單位進行研究，引發外界質疑侵犯隱私權。
憲法法庭2022年宣判必須給民眾退出權，也就是不提供個人醫療資料給任何單位2次利用，對此衛福部推動制定《全民健康保險資料管理條例》草案，但是遭立委批評衛福部旗下設置健保資料諮議會監督防護，根本是球員兼裁判，不具獨立、公正性。
民眾黨立委陳昭姿質疑，「主管機關對於人民個資的使用應該要建立獨立監督機制，但目前草案中的健保資料諮議會的設計，根本就沒有獨立性。」
衛福部長邱泰源說明，「我們就是因為這個憲判它說不明確，所以我們這個法就讓它明確，請委員提供寶貴的意見。」
另外，也有立委建議草案應增列禁止營利使用，非中華民國境內登記設立之大學、法人、機構不得申請等相關規定，以防範2300萬人民就醫資料外洩。
民進黨立委林月琴提醒，「如果沒有好好規劃，將更方便犯罪者透過學校跟醫學中心研究單位取得。」
健保署長石崇良回應，「我們現在所有的資料利用要在特定指定的空間，它是一個隔離的環境，所能攜出的只有統計之後的結果資料，所以所有的個資或原始資料是不可能攜出。」
由於憲法法庭判決後應於3年內完成修法，立法院衛環委員會9日針對行政院版本及立委提案，共2個版本進行審議。
衛福部強調，不論草案是否完成三讀，退出權都會如期在今年8月12日上路，而這也是首次辦理健保資料庫退出權，初步規劃書面申請模式，等制度穩定後再逐步採取線上申請。