台大醫院企業工會接獲多起員工投訴，指控院方要求護理師要回捐防疫津貼，護理師迫於人情壓力只能接受，對此，院方回應已經重提報請領津貼的名冊，管理缺失的部分也在評估處理中。
拿出去年1到3月份護理長要求防疫津貼回捐的簽名證據，還有5、6月紙本清楚寫著捐公三成，臺大醫院企業工會指控，去年就有接獲同仁投訴，臺大醫院要求部分單位要把防疫津貼分給清潔人員，今年又爆出要求同仁回捐給病房當公基金，而且數目累計高達上萬元。
受害當事人說，「二次回捐的時候，單位是以共識的美名，要求我們要簽自願回捐的紙，若不簽不捐就會被獵巫，說是叛徒，讓主管難做人。」他又補充，「護理部也說因為是共識所以管不到，無法介入，所以在這種壓力底下，很多人還是選擇簽名和回捐。」
另外員工也反映今年度申報的防疫津貼，並未要求基層員工簽名，造成申報的金額和實際申報數目不符，工會呼籲如果院方沒有妥善處理津貼回捐，以及造冊不透明的行為，持續縱容主管濫權，將會彙整員工投訴證據向上級舉報。
臺大醫院企業工會秘書長王棋筠指出，「今年度申報的防疫津貼並未要求基層員工簽名，造成申報金額與實際工作的時數不符，工會認為台大醫院應該要落實防疫津貼的申報公開透明，對於相關的爭議也應該要啟動第三方工會監督。」
院方回應，簽名部分是去年衛福部的表格中的確有要求，但今年沒有，只有要求護理長要先和當事人說明，所以並不是故意讓員工沒有簽名，而護理長也有善盡告知義務。另外關於回捐津貼的部分，醫院已經重新提報了請領津貼的名冊，若有護理長管理缺失，也已經在評估處理中。