基隆市政府以及護海公投領銜人王醒之，不服行政院撤銷護海公投案，提起訴願，遭訴願審議委員會予以駁回。王醒之表示，不排除提起憲法訴訟。
護海公投領銜人王醒之指出，「台電規劃它的發電量暴增到260萬瓩，所以最後會導致二氧化碳的排放量會是現在的3.4倍，懸浮微粒的總排放量會是現在的1.9倍。對於已經忍受重油發電汙染，以及火力發電，用肺發電將近一世紀的基隆人來說，非常的不公平與不公義。」
王醒之表示，對於結果雖然不意外，但仍感到非常遺憾，守護外木山行動小組會窮盡一切法律救濟途徑，捍衛憲法所保障的地方公投。
基隆市長謝國樑表示，這項公投是基隆人應有的權益，如今訴願被駁回，市府會審慎評估其他救濟方式，市府討論後會再向外界說明。