花蓮縣政府2016年大幅調高礦石稅引發重大爭議，影響縣府財政，遭監察委員提出糾正。花蓮縣府表示尊重，但強調特別稅條例草案已送財政部，縣府一切合法。
根據監委調查，花蓮縣礦石稅因漲幅超過地方稅法通則規定的30%，已遭最高行政法院判決敗訴，且2021年制定特別稅條例草案時，又未能完成法定備查程序，導致稅減少8億，須增編舉債6億支應歲出。
監察委員趙永清表示，「縣政府沒有按照法院的判決，重新給予他新的費率，合理適當的費率，有違相關的行政程序跟一般法律規定，因為這個爭議的關係，現在這個礦石稅都還沒有恢復，這個財源也就損失了大概8億左右。」
消息傳回花蓮，曾因審查礦石稅而遭議論的議員非常感概，非常擔心後續會不會有礦石業者群起效尤，如果都提出告訴，將來花蓮縣政府要怎麼還債。
花蓮縣議會議長張峻表示，「花蓮議會早在兩年前，就曾經把礦石稅退回，希望縣政府能夠再重新調整稅率，但是很遺憾，花蓮縣政府一直強渡關山。」
面對監察院的糾正，縣府表示尊重，強調特別稅條例草案已送財政部，縣府一切合法。花蓮縣政府研行處長吳坤儒表示，「在所有的審議過程裡面提早就已經在準備，將法案送到議會，再由議會審議後送到財政部，但財政部一直沒有備查。」
此外，監委調查還發現，花蓮縣府還對業者故意延遲合法的展延許可，相關糾正案已在11月初提出，並獲監察院財政及經濟委員會、社會福利，及衛生環境委員會聯席會議審議通過。