立法院昨（28）日三讀通過《立法院職權行使法》，但爭議仍未平息，民進黨團已經表態將聲請釋憲，行政院則有移請立院覆議救濟手段。行政院長卓榮泰指出，多項條文內容有侵害人民權益、違反權力分立以及法律明確性原則等憲法爭議，喊話朝野應重新審視法案，透過民主對話，捍衛憲政程序。
立法院28日三讀通過《立法院職權行使法》， 三讀修正，將總統國情報告常態化、立院調查權及聽證權、藐視國會罪和強化人事同意權入法。
綠委批評，相關條文有疏漏，藐視國會罰鍰漏寫了「新台幣」，單位只有「元」，根據現行法規會以新台幣3倍計算，也就是最高可處60萬元
民眾黨立院黨團總召黃國昌認為，「當然啦，有寫新台幣是比較好，但沒有寫的話就看一下其他行政裁罰的法規。不會被罰60萬。」
但公民團體批評程序不正義且實質違憲，行政院長卓榮泰深夜也發文回應，這次許多條文內容有侵害人民權益、違反了權力分立，以及法律明確性原則等憲法爭議，行政院將研議提出覆議。
依憲法增修條文規定，行政院對於立法院決議的法律案、預算案和條約案，如認為有窒礙難行時，得經總統核可，在決議案送達行政院10天內，移請立法院覆議。
民進黨立院黨團總召柯建銘指出，「賴總統要怎麼作為，自有國家的高度，他是1個憲法守護者，乃至於行政院提覆議，我們當然尊重，但是我們黨團絕對提出釋憲，這是毫無疑義。」
柯建銘表示，釋憲要等總統公告後才可以提出，這是必然程序，也尊重行政院提出覆議。
國民黨立委徐巧芯認為，「卓榮泰他要提覆議，或者是民進黨要提釋憲，那也都是他們的權利，那我們是按照我們的權利，完成三讀的法案。」
司法院秘書長吳三龍認為，「不便現在就這個馬上表示意見，那有問題我們內部會精準的去研究如何處理，精準比較重要。」
監察院則表示，立院通過國會職權法案三讀部分條文，未能符合憲法與大法官歷次解釋畫定框架，程序也未臻完備，已經涉及違反權力分立。