北京在56天無本地新增武漢肺炎病例後，從6月11日起，連續三天出現本土確診病例。尤其是6月13日，單日暴增36起本土病例，初步被認為是感染源的新發地市場緊急關閉休市，官方也宣布北京進入非常時期。

武漢肺炎疫情在北京，似乎有再度蔓延趨勢，初步被認為是感染源的新發地市場緊急關閉休市，波及到周邊的社區，民眾無法外出，只能隔著柵欄買菜。而新發地市場是北京重要的大型批發市場，無法營業，嚴重衝擊當地民生，有民眾擔心買不到菜，緊急到超市採買，還一度大斷貨。

北京連續三天都爆出本土確診病例，也讓官方宣布，北京進入非常時期。

北京市委宣傳部副部長徐和建表示，「北京市近日連續爆發確診病例和核酸檢測陽性病例，且都與新發地批發市場關聯，北京已進入非常時期。」

根據官方統計，連續56天沒有出現新增本土病例的北京，從6月11日起，兩天內出現7起本土確診，13號更暴增36起本土病例，全都與新發地市場有關聯。

北京市疾控中心副主任龐星火指出，「在新發地市場工作者37（實際27）例，曾直接或間接暴露於新發地市場者9例。」

武漢肺炎恐怕再度爆發，北京民眾人心惶惶，由於傳出切鮭魚的砧板，有驗出新冠病毒，檢測人員不敢大意，對於市場裡的海鮮，一一採檢，更有專家提醒，暫時不要生吃鮭魚。

中國疾控中心前研究員曾光表示，「是感染了三文魚（鮭魚），還是就是三文魚（鮭魚）是感染在前或者是從外地來的，或者是從進口的，這些問題沒清楚前，我建議大家不要生吃三文魚（鮭魚）。」

曾光認為，北京疫情正在遭受重要的考驗，如果處理不好，有可能會形成第二波疫情，還指出，從先前的確診病例上採取的病毒株樣本檢測後，初步判斷不是中國本土型的病毒，但必須繼續擴大檢測，才能確實判斷疫情走向。