索馬利亞政府根據聯合國大會第2758號決議，堅持「一個中國」原則，公告從今（2025）年4月30日起，台灣護照或相關旅行證件不得再用於進出索馬利亞聯邦。對此，我國外交部除了表達嚴正抗議，同時也呼籲國人別前往索國、確保安全。學者認為恐怕是我國過去承認索馬利蘭、打破「一索原則」的懲罰，但也表示這樣的報復行為對於台灣在非洲他國的影響應該有限。
2025國際評比最強護照排行，根據國際航空運輸協會（IATA）公布，冠亞軍寶座都是來自亞洲國家，分別是新加坡、日本，台灣則位居第33名，較去（2024）年上升2個名次。不過外交部突然公告，索馬利亞民航局22日表示，因為「一個中國原則」的關係，4月30日開始，所有台灣的護照及相關旅行證件都不得用於進出及過境索馬利亞聯邦。
民進黨立委賴瑞隆指出，「中共的文攻武嚇始終沒有停止，不管是軍機、軍艦的軍演，連我們的護照在全世界其實都相當好用，而中國還是持續打壓台灣。」
外交部發言人蕭光偉回應，「對於索馬利亞政府錯誤解釋聯大第2758號決議，並與所謂一個中國原則掛勾，圖謀製造台灣隸屬於中華人民共和國的假象，外交部也予以嚴正駁斥並強烈譴責。」
目前我國與索馬利亞聯邦共和國沒有正式外交關係，也沒有在對方首都互設具大使館功能的代表機構。但2020年，我們事實上承認了緊鄰的索馬利蘭共和國是獨立國家，並互相設立代表處。
學者表示，雖然這看似是基於我們破壞一索原則的懲罰，但其實對於台灣在非洲實質影響並不大。
政大政治系兼任教授嚴震生表示，「剛好這個議題是比較敏感一些，我們過去也因為索馬利亞的海盜，曾經我們就是有漁船被劫，所以也發生了一些矛盾，我們很多非洲國家不是也免簽嗎？我們要簽證有些的地方你還是可以去拿到，甚至我們的台商可以跟當地的一些商會取得一個默契，就是由當地的商會出這個證明也可以拿到簽證，所以並不是完全會被封殺。」
NGO組織像是無國界醫生團隊在索馬利亞提供門診、麻疹治療等服務，或者像是世界展望會同樣也在當地提供人道救援，但都表示目前沒有來自台灣的前線救援人員在索馬利亞參與任務。
外交部也表示，不管事索馬利蘭或索馬利亞兩地，沒有我國台商或學生等國人居留，但呼籲在撤銷公告以前，先別前往以保障人身安全。