陸委會主委邱太三日前表示，維護中華民國不算台獨，更說前總統馬英九主張兩岸互不隸屬，已經不足，兩岸應該互相承認主權。國台辦回應此夾帶兩國論，而前總統馬英九認為這一步不對；前陸委會主委趙建明則指邱太三踩到紅線。但也有學者分析，其實北京態度很明顯，中華民國跟台灣都是台獨，國民黨該思考新的兩岸論述。
陸委會主委邱太三先前表示，如果「維護中華民國的主權」不算台獨，應該會是兩岸協商較好的基本條件，被藍營解讀靠向前總統馬英九的主張。不過邱太三24日表示，兩人不一樣，強調兩岸互不承認主權說法已不足，拋出兩岸應該「互相承認主權」，引發議論。
前總統馬英九則認為，「這一步是不對的，他也知道我以前主張，兩岸互不承認，主權互不否認治權，這個就有互動的空間。你要相互承認主權，大陸不可能承認台灣有主權。」
前總統馬英九認為，對岸不可能承認我國主權，到時候又會出現「不希望發生的事情」。前陸委會副主委趙建民也表示，在俄烏戰事緊張的時刻，邱太三的說法顯然是踩到紅線，認為蔡政府的兩岸政策，已經像陳水扁一樣越來越激進。
文化大學社科院長趙建民表示，「一開始上任的時候就職演說，都希望追求兩岸的和平，提出都是比較有妥協性的一些政策，可是都是曇花一現，然後就越來越激進，刻意去踩人家的紅線對我們有什麼好處。」
對於邱太三說法，總統府、民進黨都沒有進一步說明。國台辦認為，邱太三「維護中華民國不是台獨」說法夾帶兩國論，持續謀獨挑釁；學者則認為，邱太三互相承認主權說法，其實沒有違背《憲法》及民進黨的主張。
政大東亞所名譽教授丁樹範認為，「什麼中華民國跟台灣，對它來說都是台獨啦。北京現在立場其實很簡單，所以為什麼北京現在對國民黨也很不滿意，因為你一中各表，等於是要我接受中華民國。」
丁樹範分析，北京的態度很明顯，沒有一中各表的空間，只承認中華人民共和國。現在邱太三提出維護中華民國，及兩岸互相承認，都是希望對等溝通，也是拋球給國民黨，是否還要堅持目前的兩岸主張。