彰化縣衛生局這場風波，指揮中心更要求政風處調查程序，台北市長柯文哲表示不介入，不過強調台灣只是暫時安全，他也批總統蔡英文不需要特別出來講話。

台北市長柯文哲21日出席警察局親子日活動，跟孩童拍照同樂，對於彰化縣衛生局違背有症狀才採檢的政策，私自採檢無症狀者，雖然驗出確診，但防疫指揮中心下令政風處調查，引發中央跟地方衝突。柯文哲不介入雙方的口水戰，倒是把砲口對準總統蔡英文，指她不該表態力挺陳時中。

台北市長柯文哲表示，「我是不太想介入那個中央跟彰化縣政府那種情緒或口水之戰，我跟你說，還有很多正事要做，所以其實我覺得也不需要總統出來講話，各退一步就假裝沒發生這件事情就好了。」

柯文哲強調，台灣目前只是暫時安全，要將重點擺在落實防疫工作，至於外界議論紛紛的精篩、普篩，柯文哲表示，篩檢涉及專業作業，彰化可以做小規模研究，像台大公衛所就曾訊問北市府，但台北規模太大，抽樣要多元，不容易設計。而北市首創防疫旅館，建立旅宿業者防疫SOP，現在卻有近20家一般旅館開放檢疫者入住。

柯文哲表示，「我們也不會去逆時中，我還是專業人士，所以這種防疫問題，像入境要集中管理，這個一定知道。我想這個你去問那個張上淳或問誰，他們一定也會贊成我意見。」

針對一般旅館卻收檢疫者，柯文哲表示，還是有相關懲處辦法，喊話業者盡速完成清場，而觀旅局預計21日下午5點公布違法業者名單。