除了農地污染問題，沿海地區也有爭議。花蓮漁港能不能垂釣，最近又開始延燒，有漁民檢舉除了髒亂之外，釣線有時還會捲入船隻，嚴重影響航道，因此花蓮縣府宣布下禮拜開始，依法開罰最高15萬，但也引起釣客不滿。
釣客李先生表示，「釣個魚而已 ，開的罰單比那個酒駕那些還嚴重，釣魚又不是作奸犯科。」
另一位釣客王先生則說，「當初有下公文，說你漁港要規劃一個地方要給人家釣魚，4年了你到現在都還沒有規劃，是不是你縣政府瀆職。」
花蓮區漁會表示，原本港內就無開放垂釣也鮮少真的取締，但最近實在有太多漁民檢舉，釣客在航道邊釣魚嚴重影響漁船進出，加上垃圾也不帶走，漁會也很頭痛。
花蓮區漁會理事長王登義表示，「我們所看到的垃圾，還有一個就是在這邊大小便，漁船出去的時候他們也不收桿，也有絞到魚線，1年大概發生5、6次。」
釣客批評縣府無視中央現行的《漁港法》第18條規定，主管機關在不妨礙港區作業、安全及不造成港區污染情況下，應指定區域、訂定相關措施，公告開放民眾垂釣，要求縣府必須開放適當地點。
對此花蓮縣政府農業處長陳淑雯表示，「東堤那邊是有開放六、日，進行可以釣魚的一個時段 ，這部分是港公司做轄管，目前根據了解，應該是因為災復工程的整修作業，所以有一個禁止開放的狀況。」
縣府強調，下週開始會成立稽查小組前往取締，如釣客屢勸不聽，將依《漁港法》第21條，處新臺幣3萬元以上、15萬元以下罰鍰，釣客則是無法接受，不排除發動抗議。