近期新生兒腸病毒疫情拉起警報，疾管署公布，2025年統計至今累計7例重症，其中有5例是新生兒，而且已出現4例死亡，皆感染伊科病毒11型。專家示警，新生兒感染腸病毒，易引發敗血性休克等，呼籲孕婦從生產就要注意，有無流鼻水、睏倦等症狀，並謝絕訪客，避免傳染。疾管署也成立應變小組，近期將召開專家會議應對疫情。
腸病毒疫情拉起警報，尤其新生兒，近期出現多名重症個案。疾管署17日公布，上週新增1例腸病毒感染併發重症個案，是南部一名男嬰，出生3日就出現發燒與呼吸窘迫症狀，後續出現休克、肝炎心肌炎等。
另外還新增2例死亡，分別是南部出生6日的女嬰，以及出生3日的男嬰，全都是感染伊科病毒11型。
疾管署副署長羅一鈞表示，「預估可能要到9月才會進入整體腸病毒的流行期，但是在新生兒部分，因為重症一直接二連三地出現，我們也是連續兩週已經有新增了3例的重症個案，加上還有死亡的個案，表示說這一波新生兒的腸病毒疫情，事實上是很特殊。」
根據疾管署統計，今（2025）年腸病毒重症累計有7例，其中5例是新生兒，出現4例死亡。
專家警告，伊科病毒11型不像過去克沙奇病毒71型，會有口腔潰瘍症狀，一旦成年人感染症狀輕微難察覺，不過新生兒感染，會攻擊肝臟、心臟，引發敗血性休克等，病程變化又急又猛。疾管署也成立應變工作小組應對疫情。
台灣新生兒科醫學會理事長楊生湳指出，「媽媽得到以後，甚至媽媽會以為流流鼻水，以為是過敏性鼻炎，所以其實嚴重的話，如果媽媽已經到達發燒，或出現一些上呼吸道感染，其實就要通知婦產科醫師。一般的長輩們在這個高度疫情流行的時候，應該儘量就減少人員對新生兒的親親抱抱了。」
另外，國內新增3例境外移入瘧疾病例，都是惡性瘧重症個案，其中兩人同行前往肯亞，是6年來首起境外移入瘧疾群聚。另一名個案為北部40多歲男姓，曾前往西非貝南共和國出差，目前昏迷插管，可能須洗腎，尚未脫離險境。
疾管署提醒，民眾前往高風險區，務必4到6週前前往旅遊醫學門診，接種疫苗及領取預防藥物。