國立原住民博物館現場址預定今（2025）年底前動工，這禮拜卻出現好幾台怪手，將周邊綿延約1公里的次森林植被給移除。民團質疑這些次森林約花20年養成，當地生態也很豐富，移除植被舉動恐已破壞水土保持，呼籲施工單位停工；市府回應動工是基於去（2024）年颱風後場址許多枯木倒枝等狀況，為免病媒蚊孳生進場清理環境，沒有濫墾濫伐。
怪手大面積動工後，本是綠蔭的次森林的樣貌變成光禿的黃土，只保留樹冠層的景觀橋木，讓護樹及民間團體質疑是破壞水土保持。
森林城市協會理事長莊傑任指出，「博物館這麼多的森林它都要保留，動工前、還不是正式工程，就一堆怪手進來把樹挖掉，會讓我們覺得有一點詫異，明明就要動工了為什麼要急著來，做這樣子破壞性整理呢？」
高雄市公督盟理事長陳銘彬表示，「砍樹後種草皮就比較好看嗎？從淨零減碳或是都市景觀各方面來看，種草皮沒有比較好。」
民團指出，遭毀的山坡森林是國立原住民博物館場址，預定今年要動工。基地有許多20年養成的次森林，場址土地約有80%都是山坡地，甚至其中也有5成以上是15度以上山坡地；原博館的環評也看出基地生態豐富，有鳳頭蒼鷹、黃鸝等多種保育類動物，植物清除也可能導致牠們生存環境消失，呼籲市府停工。
高雄市工務局公園處長林燦銘回應，「針對枯樹枝等等的清理，相關的自然生態復育部分，我們儘量保留相關的一些植被。」
市府表示，此案是因為去年颱風後許多倒木及毀壞廢棄物，加上澄清湖青年活動中心自民國105年底歇業後就沒人管理，為免病媒蚊孳生才會進場環境，沒有濫墾濫伐，後續生態復育的部分也將參考民團意見。