日本國會圖書館傳出官網的頁面將台灣標示為中國省分，有民眾發現英文版的網頁在註冊會員部分，居住地包含世界各國也有納入台灣，卻被標示為中國台灣省「TAIWAN, PROVINCE OF CHINA」。對此，在日台僑團體「全日本台灣連合會」致函國會圖書館館長吉永元信表達嚴正抗議。
外交部發言人劉永健表示，「外交部已注意到英文版註冊網頁上的錯誤，並已立即指示我國駐日本代表處向該圖書館提出嚴正抗議，聲明我國是主權獨立國家，與中華人民共和國互不隸屬，要求該圖書館更正此嚴重錯誤。」
「全日本台灣連合會」則指出，這是變相強迫台灣人或居住在台灣的使用者承認台灣是中國一省的做法，對台灣人是莫大侮辱，且不符事實。
外交部也表達關切，指日文註冊網頁有正確標示台灣，但英文版用錯標示，已要求駐日代表處表達嚴正抗議，更改嚴重錯誤。