華航機師接連染疫造成國內防疫威脅升高，國內醫師就建議，疫情指揮中心應針對航空機組員、外籍移工及船員等高風險染疫族群，定期採檢血清抗體，主動找「隱形傳播鏈」；且近期國人漸漸對新冠病毒的失去戒心，指揮中心勢必重擬對策，避免一再補破口的窘境。
北醫胸腔內科主任周百謙指出：「目前病毒它的一個演化趨勢，是慢慢會適應人體的環境，所以我們常常會注意到，從華航這一批到之前，這些國外入境的一些無症狀帶原者，有些是檢疫結束才出現，有些則是以喉嚨痛這些比較非特異型的表現，所以我們會希望指揮中心盡快去做一個比較，大規模的一個內部篩檢，來找到可能的一些隱形傳播鏈。」
醫師表示，越來越多的無症狀、輕症帶原者，尤其是咽喉不適與微燒都是呼吸道疾病的常見症狀，導致確診案例辨識困難，也讓這回華航群聚事件追蹤是否成功有困難度，加上國人漸漸失對新冠病毒的戒心，指揮中心勢必重擬對策，才能避免一再補破口的窘境。
近期疾管署公告新冠疫苗冷鏈倉儲採購需求，其中包含需運送攝氏負七十度冷鏈技術五十萬劑、負廿度一百萬劑，也讓各界關注是否是為了COVAX購得的輝瑞BNT疫苗來做準備。
台灣兒童感染症醫學會理事長李秉穎說明：「本來就是跟莫德納私下有簽約，要買他們的疫苗，然後我們COVAX他在分配疫苗的時候，也有可能把輝瑞的RNA疫苗放到考慮裡面去，所以我們台灣才會有機會拿到這兩種不同的疫苗。」
醫師表示，疫苗接種率必須打到60-70%才會有群體免疫的效果，接下來陸續會有包括國產蛋白疫苗及其他國外疫苗進到台灣，預計5、6月之後疫苗接種應該可以大幅度加快。