國民黨團將推動總統大選適用不在籍投票，包括增加境外投票、通訊投票等，在國會引發朝野攻防；民進黨團批評，國民黨為中國境外勢力介選提供管道，國人在中國無法靠自己意志投票；民眾黨團認為，先推移轉投票方法可行。而行政院長陳建仁今（12）日表示，目前行政院沒有針對不在籍投票有相關規劃。
不在籍投票議題發酵，國民黨立委提出的版本納入總統大選，包括增加境外投票、通訊投票，與行政院版本限定在全國性公投以及移轉投票，兩者有落差。
行政院長陳建仁12日表示一定要確保投票的公正性，行政院對公職選舉，目前沒有不在籍投票的規劃，「對於公職選舉的這些辦法，我們目前並沒有相關的規劃。如果要做不在籍投票，我們需要在選務的加強以及如何達成選舉的秘密性、正確性跟公平性，都需要來研議。」
針對藍委提出境外投票可能包含中國，被質疑為中國介選開大門，民進黨批評，台灣若在中國境內設立投開票所，或者採取通訊投票，中共可依相關國安法律檢查郵寄投票，恐害國人深陷危險遭法辦。
民進黨立委吳思瑤質疑，「我們的國人在中國投票，如果被中國法辦了，怎麼保護國人安全？然後在武警荷槍實彈的監視之下進行投票，這種投票是自由民主的投票嗎？」
民進黨團認為，國人在中國無法按照自己意志投票，國民黨提案版本既違憲又危險，不過國民黨徐巧芯也反駁，並反控民進黨抹紅。
國民黨立委徐巧芯回擊，「不管是海外的部分或是境內的部分，不在籍投票都沒有任何人提到非得在中國大陸設投票所不可，但是民進黨卻講得好像國民黨只在中國大陸設投票所。」
民眾黨立委黃珊珊表示，「我們台灣民眾黨講的叫做，希望能夠尊重所有國民的參政權，在不在籍投票沒有形成國內共識之前，現在比較有共識的是移轉投票。」
至於民眾黨團支持不在籍投票，但黃珊珊強調，目前國內沒有形成共識，現階段先推動移轉投票。