台鐵6月23日起調整票價，由於中央承諾要給花東居民優惠票價，台鐵初步推出針對於設籍花東的旅客，購買花東對號車票點數加碼優惠，不過換算下來相當於調整後票價的95折，被在地民代抨擊，遠不及票價調整的幅度。而花蓮觀光協會則說，安全改善前應該凍漲。
非假日的下午前往花東的新自強號，旅客零零星星，聽聞台鐵計畫對花東旅客推出點數加碼回饋的優惠，相當於調整後的票價約95折，旅客有不同看法。
花蓮旅客陳先生認為，「折扣倒不用，趕快把交通建設弄好比較重要。」
台中旅客黃先生則說：「這個東部工程很艱鉅，我覺得這樣很好。95折可以接受，很好。」
台鐵規劃實名制會員購買對號列車車票，滿50元可累計1點、2點可折1元；設籍花東且購買車票起迄站任一站在花東境內，平日消費滿50元，點數是一般旅客5倍、假日3倍，換算折抵金額相當於95折。
在地立委抨擊，這折扣對比漲幅根本杯水車薪，應提升折扣比例。
國民黨立委黃建賓指出，「折扣的金額太低，另外就是長者使用不方便。交通部陳世凱部長務必遵守承諾，儘速提出更優惠的方案。」
花蓮觀光協會理事長陳義豐則表示，「代表觀光產業，我贊成凍漲，但是前提這個最基本的安全好了之後，你再來跟我們講。」
對於優惠措施挨批，台鐵回應，為促進花東地區災後重建，並提升花東線使用率，依行政院指示研擬優惠措施，會在5月底前完成方案評估，新制上路後也會開設專屬的窗口，協助民眾加入會員，即便沒有手機，也可以臨櫃用電腦辦理。