面對少子化威脅，部分大專院校利用單獨招生管道搶學生，花招百出，教育部將從明年開始，限制所有的單獨招生都必須在申請入學統一分發結果公告後，才能辦理，同時也增列，凡註冊率查填不實、未通過教育品質查核及專案輔導學校，不得申請單獨招生，被認定有重大招生違失、或獨招成效不佳，也可減招或撤銷獨招許可。
教育部高教司長李彥儀表示，「我們要進行一個品質的控管，比如說它某一個系教學品質查核沒有通過，那也許我們未來讓它單獨招生的名額會去調整，被我們列為專案輔導的學校，我們可能就不會同意它單獨招生。」
今年共有六校，包括台灣首府大學、稻江、明道、開南、中信金融管理學院及國立台北藝術大學，六校申請全校單獨招生，有18校25系申請學系獨招，教育部強調，今年不做變動，但明年開始，新制將上路，有私校認為，教育部應該漸進實施，不然將重創私校招生。
私立科技大學校院協進會理事長唐彥博提及，「以往在招生低於七成以下還有50％獨招的名額，教育部應該是漸進的方式，一次切到底重創非常大，少子化衝擊的情況下，不應該是落井下石。」
教育部強調，必須管控大學教學品質，不過已面臨少子化衝擊大學經營的私校來說，教育部此舉恐將讓招生不易的私校更加雪上加霜。
