前中研院院長翁啟惠涉入浩鼎案，去年遭到監察院彈劾，送公懲會處理。因為貪汙罪部分一審審理中，公懲會依照公懲法規定停止審理全案。形同翁啟惠被彈劾後，仍未受到任何行政處分，引發議論。公懲會強調一切依法行政，未來如果一審判決出爐，就會撤銷停審裁定、持續審理。
士林地檢署去年初，依貪汙等罪起訴浩鼎案，翁啟惠成為台灣史上、首位被起訴的中研院院長，同年7月，監察院通過彈劾，送公懲會處理。雖然內線交易部分，因為罪證不足，檢方二度處分不起訴，可是貪汙罪部分，正由士林地院審理中。現在卻傳出，公懲會依照公懲法規定，在第一審刑事判決前，裁定停止審理全案，形同翁啟惠被彈劾後，還沒受到任何行政處分 。
公懲會委員長石木欽表示，「承辦委員認為這個案件是依照公懲法第39條第一項但書，他認為有必要先裁定停止審判，因為這個案子一審還沒有判。彈劾案件進到我們委員會來的時候，承辦委員就已經裁定停止了。」
浩鼎案爆發後，去年就有超過60位中研院學者發表聯合聲明，譴責監察院的彈劾，是未審先判，對於公懲會裁定停審，就有中研院學者表示贊同，認為停審是謹慎執法的表現。
中研院自由學社社長張谷銘表示，「公懲會他是比較謹慎，他就等到司法院的司法判決出來再做裁判，我覺得這是審慎正確的。」
監委仉桂美表示，「基本上我們彈劾案送出去以後，下面的下游部分就是公懲會的部分了。所以他是本於職權依法審理，其他的就不在我們範圍了。」
當時提彈劾案的監委，雖然在調查報告中，要求中研院檢討、強化內控機制，可是，對於公懲會的作為，也只能表示尊重。而面對各方質疑，公懲會強調，未來如果一審判決出爐，就會撤銷停審裁定，持續審理翁啟惠的案子。
